第1268章 生吞培养皿赌约
3个月前 作者: 没钱又任性
为什么对于蛋白质结构的绘制这么慢?
因为只能做实验,一个一个观测,靠计算是没有办法算出来的。
一条几百个氨基酸组成的链子,每个氨基酸都要和周围所有氨基酸产生相互作用。
这里面的空间组合数,比全宇宙的原子总数还要多。
拿现有的超级计算机去硬算,算一个蛋白就得算上万年。
算不出来,就只能靠实验去肉眼看。
这就是传统的x射线晶体衍射和冷冻电镜技术。
科学家们得先把蛋白质提纯,再像熬冰糖一样,把它培养成完美无瑕的晶体。
然后拿x射线去照,或者冻起来拿电子显微镜去拍。
很多蛋白质娇气得很,死活不肯结晶。
特别是那些嵌在细胞膜上的跨膜蛋白,一离开细胞膜就散架。
往往一个顶尖大学的博士团队,耗费数年时间,烧掉几百万美元的科研经费。
每天在实验室里刷成千上万个试管,熬到头发掉光、延毕退学。
最后连一张清晰的衍射图都拿不到。
这就是著名的“蛋白质折叠问题”,一个悬在人类头顶整整五十年的终极科学难题。
全世界的生物学家,苦这玩意儿久矣。
大家辛辛苦苦四十年,全人类凑一块儿才攒了七万多个结构。
结果现在,一个不知道从哪个旮旯里冒出来的“sb”。
一天之内,直接往桌子上甩了三万多个高精度结构!
这相当于把全球科学家过去四五年的工作量,一口气干完了!
这谁能信?
这就好比你是一个老实巴交的搬砖工人,每天累死累活搬一百块砖。
突然有个蒙面人跑过来跟你说,他昨天晚上一个人建起了一座万里长城。
你第一反应绝对不是跪下来拜师,而是摸摸这人的脑门,看他是不是发烧把脑子烧坏了。
于是,从哈佛、麻省理工、剑桥,再到国内的中科院、清华。
全球结构生物学界在经历了短暂的呆滞后,爆发出了铺天盖地的嘲讽与质疑。
下午两点,大洋彼岸的波士顿。
哈佛大学医学院的一间独立办公室里。
结构生物学界的知名大牛、casp竞赛的常任评委霍华德教授,正端着一杯黑咖啡,对着电脑屏幕冷笑。
他的助教大卫站在办公桌对面,小心翼翼地看着自家老板的脸色。
“教授,casp组委会的迈克尔博士刚刚发来邮件。
问我们要不要对sb上传的这批数据进行立项评估?”大卫低声汇报道。
霍华德把咖啡杯往桌上一放,发出一声脆响。
“评估?评估什么?
评估一堆由随机数生成器搞出来的电子垃圾吗?”
霍华德嗤笑了一声,身体往椅背上一靠,满脸的不屑。
这就是学术圈大佬的傲慢。
在自己深耕了三十年的领域里。
任何超出他认知范围的东西,统统都是异端,统统都是骗局。
“可是教授,迈克尔博士说,他们初步抽检了几个文件的格式。
原子坐标的完整度非常高,不像乱码……”大卫试图解释两句。
“大卫,我的蠢学生,你跟着我读了四年博士。
难道连最基本的热力学定律都忘了吗?”霍华德毫不客气地打断了他。
大卫缩了缩脖子,不敢吱声了。
霍华德站起身,在办公室里踱了两步,开启了说教模式:
“以目前全人类的超级计算机算力。
哪怕把美国能源部的橡树岭超算中心全负荷开动。
靠物理分子动力学去硬算三万个复杂蛋白质的折叠,至少需要一万两千年!”
“这个sb是什么东西?上帝的私人计算中心吗?”
“至于做实验?”霍华德把手一挥。
“全球所有实验室加起来,开足马力一年也就攒八千个结构,他一天就三万个。
难道sb还养着十万个不要工资的博士后,没日没夜地替他摇试管、养晶体不成?”
其实霍华德心里比谁都清楚,传统的算法路线早就被证明走不通了。
不管是找相似序列照猫画虎的同源建模,还是凭经验把二级结构当积木拼凑。
亦或是穷举求能量最低,全都有着巨大的局限性。
全世界最聪明的脑袋瓜子凑在casp比赛里玩了十几年。
预测出来的结构依旧是惨不忍睹,跟真实实验测出来的差了十万八千里。
现在有人告诉他,不用做实验,光靠算,一天算了三万个?
这不光是在侮辱他的智商,更是在动摇他赖以生存的学术根基!
要是计算机点点鼠标就能把结构算出来,那他手里那几台价值上千万美元的冷冻电镜岂不是成了废铁?
他每年找基金会申请的几千万科研经费,以后还怎么要?
断人财路,犹如杀人父母。
哪怕这事儿有一丝一毫的可能是真的,霍华德也必须在舆论上把它彻底踩死!
“去,用我的推特账号发一条公开声明。”霍华德转过身,看着大卫吩咐道。
“好的教授,怎么写?”大卫赶紧拿出记事本。
“你就写,sb的行为是一场恶劣至极的学术恶作剧。
是对全球无数在实验室里奉献青春的科研工作者的亵渎。”
霍华德扬起下巴,语气傲慢到了极点。
他顿了顿,觉得这样还不够解气,又补充了一句:
“再加上一句,我以哈佛大学终身教授的名义担保。
这批数据要么是某些无耻之徒偷窃了未公开的实验结果。
要么就是用劣质算法胡乱拼凑出来的电子垃圾!”
“如果这三万个数据里,哪怕有十分之一是真的。
我霍华德,当着全院师生的面,把我实验室里的玻璃培养皿给生吞下去!”
大卫拿着笔的手抖了一下,抬头看了霍华德一眼。
“教授,这话是不是说得太满了?万一……”
“没有万一!”霍华德眼睛一瞪,“照我说的发!立刻!马上!”
大卫不敢再劝,赶紧低头记下,转身跑出去发推特了。
看着大卫离开的背影,霍华德得意地端起咖啡喝了一口。
这就叫抢占学术制高点。
反正那个sb是个藏头露尾的匿名账号。
只要自己先把定性扣死,再拉上几个老朋友一起施压。
casp官网和开源数据库迫于压力,肯定会把这批数据当成垃圾清理掉。
自己还能借着这次打假,在国际学界再刷一波耿直严谨的名声。
顺便给下个月的经费申请添把火。
简直是一举两得。
霍华德的算盘打得噼里啪啦响。
随着他这条带着“生吞培养皿”赌咒的推特发出去。
不到一个小时,立马引发了全球结构生物学界的集体狂欢。
剑桥大学分子生物学实验室主任转发点赞:
“完全同意霍华德教授的观点,这绝对是本年度最大的学术笑话。
建议数据库管理员立刻封禁该ip!”
东京大学生命科学研究所某教授留言:
“我已经让我的学生去下载这批数据了。
准备拿来做今年新生入学教育的反面教材,教教他们什么叫粗制滥造的伪科学。”